W Warszawskim Uniwersytecie Medycznym funkcjonuje System Zarządzania Jakością Kształcenia wspierający rozwój uczelnianej kultury jakości. Ogólne ramy Systemu określa uchwała nr1/2013 Senatu Uczelni. System służy realizacji „Polityki jakości kształcenia” Uczelni i wzmocnieniu jej potencjału dydaktycznego. Na poziomie wydziałowym, celem Systemu jest zapewnienie osiągnięcia zakładanych efektów kształcenia poprzez wsparcie indywidualnych i instytucjonalnych wysiłków w tym zakresie.
Warszawski Uniwersytet Medyczny stanowi wspólnotę studentów, kadry nauczającej i pozostałych pracowników Uczelni, która dąży do osiągnięcia jak najwyższego poziomu kształcenia w zawodach medycznych, badaniach naukowych, świadczeniu wysokospecjalistycznych usług zdrowotnych.
Celem strategicznym Warszawskiego Uniwersytetu Medycznego jest osiągnięcie jak najwyższego poziomu kształcenia w zawodach medycznych. Za zapewnienie wysokiej jakości kształcenia w WUM odpowiada cała społeczność akademicka. W grudniu 2010 r., w celu systemowego zapewnienia jakości kształcenia i rozwoju kultury jakości, Senat WUM przyjął uchwałę o wprowadzeniu uczelnianego Systemu Zarządzania Jakością Kształcenia (SZJK).